هرساله تعداد قابل توجهی از پروژه‌های پژوهشی و فناوری در پژوهشکده علوم محیطی و به‌سفارش مراکز و سازمان‌های مختلف انجام می‌شود که اغلب آنها کاربردی بوده، در زمینه‌های زیر انجام می‌شود:
- فناوری‌های نوین تصفیه آب و فاضلاب
- استقرار نظام اقتصاد سبز
- مكان‌يابی توسعه و استقرار صنایع
- شناسایی گونه‌های گياهی و جانوری
- انجام خدمات نمونه‌برداری و آزمايشگاهی
- پايش كيفيت فيزيكی/ شيميايی/ ميكروبی
- تدوین استانداردهای محيط زيست
- ارزش‌گذاری اقتصادی منابع طبیعی و تعیین هزينه‌های ناشی از تخریب محیط زيست
- انجام مطالعات ارزیابی اثرات توسعه بر محیط زیست
- انجام مطالعات آمایش سرزمین
