هرساله تعداد قابل توجهی از پروژه­‌های پژوهشی و فناوری در پژوهشکده علوم محیطی و به‌سفارش مراکز و سازمان‌های مختلف انجام می‌­شود که اغلب آنها کاربردی بوده، در زمینه­‌های زیر انجام می‌شود: